本病应于细菌性腹泻相鉴别：通常腹泻绝大部分是病毒引起或消化不良引起。通常我们说的细菌性腹泻往往是指菌痢，它有传染性，当然有些宝宝抵抗力很差，长期腹泻也可以继发细菌感染，如大肠杆菌，霉菌等，但不多。关于治疗方法，除了对症治疗外，帮助消化，止泻，还有就是消炎。
秋季腹泻的主要特征：先吐后泻，伴发烧，大便呈水样或蛋花汤样，病程有自限性，即使用药也不能显著改变病程，症状表现：
(1)起病急，初期常伴有感冒症状，如咳嗽、鼻塞、流涕，半数患儿还会发热(常见于病程初期)，一般为低热，很少高热;
(2)大便次数增多，每日10次左右，大于3次就应考虑秋季腹泻，大便呈白色、黄色或绿色蛋花汤样，带少许粘液或脓血，无腥臭味;
(3)半数患儿会出现呕吐。呕吐症状多数发生在病程的初期，一般不超过3天。
(4)腹泻重者可出现脱水症状，如口渴明显，尿量减少，烦躁不安;
(5)病程有自限性，病程一般5-7天，营养不良、佝偻病和体弱多病者，腹泻的时间可能更长。
病因治疗
肠道感染引起的腹泻必需抗感染治疗，以针对病原体的抗菌治疗最为理想。复方新诺明、氟哌酸（诺氟沙星）、环丙氟哌酸（环丙沙星）、氟嗪酸（氧氟沙星）对菌痢，沙门菌或产毒性大肠杆菌，螺杆菌感染有效，甲硝唑对溶组织阿米巴、梨形鞭毛虫感染有效，因此，这数种药物常用于急性感染性腹泻，包括预防和治疗所谓旅行者腹泻。治疗乳糖不耐受症和麦胶性乳糜泻所致的腹泻在饮食中分别剔除乳糖或麦胶类成发。高渗性腹泻的的治疗原则是停食或停用造成高渗的食物或药物。分泌性腹泻易致严重脱水和电解质丢失，除消除病因，还应积极由口服和静脉补充盐类和葡萄糖溶液，纠正脱水。胆盐重吸收障碍引起的结肠腹泻可用消胆胺吸附胆汁酸而止泻。治疗胆汁酸缺乏所致的脂肪泻，可用中链脂肪代替日常食用的长链脂肪，因前者不需经结合胆盐水解和微胶粒形成等过程而直接经门静脉系统吸收。
根治方法
通过增强大肠经小肠经的免疫能力后，通常是两星期就可以治好。需要指出的是，针灸虽然可以将腹泻治好，提高肠胃消化功能和免疫能力，但如果还是暴饮暴食，大鱼大肉，或是不运动，或是吃太多辛辣食物，或是饮食生活不规律，均可导致再次发作。
三种腹泻不用吃抗生素
1．病毒性腹泻：这种腹泻都属于自现性的，抗菌素不起作用，多吃也没有用。但是极易由于上吐下泻造成脱水，特别是上了年纪的人，本身再有一些基础病就容易引发其他病变，如心功能不全等。如果年轻人出现呕吐、腹泻的情况，可以在家喝些加糖、加盐的水，还可以吃一些收敛药物，比如肠乐、整肠生、金双岐等生物制剂。
2．旅行者腹泻：在卫生条件不好的地方饮食卫生得不到保障，这种情况下传播的腹泻也没有必要用抗生素，因为这种腹泻很快就能自愈，只要身体别脱水，适当吃些收敛的药，有的人抵抗力好，甚至不用吃药，几天内就会康复。
3．秋季食物中毒造成的腹泻：只要水电解质平衡没有出现异常，都不用吃抗生素，可以多喝水，补充电解质并避免乳制品及固体食物，旅行时避免未煮熟的蔬菜、肉类、海鲜及不洁的饮料，多喝可乐、柳橙汁等酸性饮料，有助于抵制大肠杆菌的数量。
黄连素治疗腹泻药慎用
黄连素的通用名叫盐酸小檗碱，是从黄连、黄柏等小檗科植物中提炼出来的一种抗菌性生物碱，黄连素能对抗病原微生物。
黄连素是化学合成药物，不是中成药，对于中医辨证为脾胃虚寒型的腹泻，黄连苦寒，反而易伤脾胃，损害胃肠功能，更易出现胃痛、恶心等消化系统症状，加重病情。
因此，对于不明原因的腹泻不能随意服用黄连素，最好能根据医院粪便、血液检查情况选用，一般性腹泻1-2次无其他伴随症状，由饮食不节、水土不服等因素引起，保持清淡饮食，人体即可自行恢复，但反复发作就要查明原因了。
中西医治疗湿热型腹泻
1.中医治疗
给药方法：1剂药煎2次，每次前100-150ml，早晚各1次，滴注保留灌肠。用输液管去掉针头，插入肛门每分钟30滴缓慢滴入，保留时间越长效果越好。灌肠药液必须川纱布滤，防止药渣堵住输液管。
2.西医治疗
(1)控制感染：根据致病菌选用相应的抗生素治疗。一般可用氨苄青霉素、复方新诺明、氟呱酸等抗生素。
(2)补液：轻度脱水可口服补液盐，严重脱水可静脉输液。
(3)治疗休克：调整微循环紊乱，纠正酸中毒，可应用血管扩张药及碱性药物。
(4)对症支持治疗：腹泻次数过多者可用止泻剂，伴有心衰、脑水肿、休克肺、弥漫性血管内凝血等;应及早给予对症治疗。
